1969年。明年即將舉行大阪萬國博覽會，同時也是人類第一次踏上月球的年份。全日本都覺得未來一片美好。
那年夏天，就讀國小的賢知跟同學阿區、丸夫、義常、阿門、噹機、雪次、福平一起在空地草原建造了一個秘密基地。他們想出了一個驚人的計劃，並在「預言之書」上寫下邪惡組織、人類滅亡等情節，以及正義伙伴如何阻止滅亡計畫…等幻想。
近三十年過去，長大的賢知經營便利商店，一手扶養失蹤姊姊留下的小嬰兒神乃，現實生活讓他不得不放棄成為搖滾巨星的夢想。但是一位顧客突然神秘失蹤以及國小同學噹機死亡，卻從此改變了賢知的世界。
此時，自稱是「朋友」的人所率領的神秘宗教團體，開始出現並日漸壯大。詭異案件層出不窮，而且這些案件都跟賢知小時候寫下的預言之書一模一樣，將賢知與眾人串連了起來。
這些案件是「朋友」犯下的嗎？「朋友」真的想要毀滅世界嗎？「朋友」是賢知小時候的伙伴之一嗎？預言之書上寫的事件一個接著一個實現，挺身而出要阻止這個計畫的賢知派，卻被勢力強大的「朋友」冠上了恐怖份子的罪名。
2000年12月31日，預言之書裡寫著：「人類將在這一天滅亡！」
當天，一個巨大的身影，伴隨著轟轟作響的巨大腳步聲出現在東京。核子動力機器人一邊散播細菌一邊肆意破壞街道！21世紀到底會不會到來呢？全世界的命運又會如何呢？
電影改編自日本知名漫畫家浦澤直樹的同名作品，故事背景橫跨1960至2010年，漫畫連載多年，以角色豐富、曲折情節受到歡迎，也包含了日本近三十年的時代面貌，還有友情、科幻、情親與夢想等元素。電影《20世紀少年》三部曲耗資60億日幣(台幣17.5億)，橫跨八國取景，最後一章於2009年上映。
